Protein–RNA interactions for Protein: Q92565

RAPGEF5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF5Q92565 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAPGEF5Q92565 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF5Q92565 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms