Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113Q902F9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms