Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCAF4Q8WV16 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms