Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms