Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BRSK1Q8TDC3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms