Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA4Q8NEY3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms