Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AGBL3Q8NEM8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGBL3Q8NEM8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGBL3Q8NEM8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGBL3Q8NEM8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AGBL3Q8NEM8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGBL3Q8NEM8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL3Q8NEM8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL3Q8NEM8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL3Q8NEM8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL3Q8NEM8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL3Q8NEM8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL3Q8NEM8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL3Q8NEM8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL3Q8NEM8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL3Q8NEM8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGBL3Q8NEM8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AGBL3Q8NEM8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGBL3Q8NEM8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGBL3Q8NEM8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGBL3Q8NEM8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGBL3Q8NEM8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGBL3Q8NEM8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGBL3Q8NEM8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGBL3Q8NEM8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AGBL3Q8NEM8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms