Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3C3Q8NEB9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms