Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB37

GATD1, Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1Q8NB37 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATD1Q8NB37 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms