Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L2Q8NAA4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L2Q8NAA4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms