Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC63Q8NA47 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms