Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms