Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms