Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms