Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFRP1Q8N474 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms