Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KLHL34Q8N239 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL34Q8N239 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms