Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms