Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms