Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCGF5Q86SE9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCGF5Q86SE9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCGF5Q86SE9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCGF5Q86SE9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF5Q86SE9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF5Q86SE9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms