Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms