Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RBBP6Q7Z6E9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms