Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRGAP1Q7Z6B7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRGAP1Q7Z6B7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRGAP1Q7Z6B7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP1Q7Z6B7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP1Q7Z6B7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP1Q7Z6B7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP1Q7Z6B7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP1Q7Z6B7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP1Q7Z6B7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP1Q7Z6B7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP1Q7Z6B7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP1Q7Z6B7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms