Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMC3Q7Z5M5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms