Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT27Q7Z3Y8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT27Q7Z3Y8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms