Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC11Q7Z392 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms