Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTF1AQ7RTS3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTF1AQ7RTS3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTF1AQ7RTS3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms