Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARCQ7LC44 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARCQ7LC44 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARCQ7LC44 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARCQ7LC44 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARCQ7LC44 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARCQ7LC44 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARCQ7LC44 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARCQ7LC44 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms