Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYFIP1Q7L576 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYFIP1Q7L576 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms