Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms