Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFVQ71UI9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFVQ71UI9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFVQ71UI9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms