Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms