Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
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USP31Q70CQ4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP31Q70CQ4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
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