Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBR3Q6ZT12 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
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