Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN12Q6ZSI9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms