Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNI2Q6ZMN8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms