Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VITQ6UXI7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms