Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXC1

MAMDC4, Apical endosomal glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAMDC4Q6UXC1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAMDC4Q6UXC1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAMDC4Q6UXC1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAMDC4Q6UXC1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAMDC4Q6UXC1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAMDC4Q6UXC1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAMDC4Q6UXC1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAMDC4Q6UXC1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAMDC4Q6UXC1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAMDC4Q6UXC1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAMDC4Q6UXC1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms