Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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