Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
APOA5Q6Q788 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOA5Q6Q788 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms