Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms