Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms