Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFCAB12Q6NXP0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms