Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDE2Q6IQ49 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms