Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ETFRF1Q6IPR1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms