Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUPD1Q68J44 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUPD1Q68J44 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUPD1Q68J44 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUPD1Q68J44 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUPD1Q68J44 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms