Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALS2CLQ60I27 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms