Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CHIC1Q5VXU3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms