Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms