Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD1Q5VV17 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD1Q5VV17 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms