Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC38Q5VT99 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms